1、沟藏
山东烟台等地多年来根据当地的气候条件，采用开沟贮藏青香蕉、国光等晚熟苹果。可贮藏到明年2-3月份，重量损失仅2.5%左右。一般在果园或果园附近选择地下水位较低，向阳背风的平坦地段挖沟，沟深大约1米宽1.5米左右。沟长可根据地形和贮量而定，一般长25米左右。可贮苹果十吨。
贮藏前，先在沟底铺一层6-7cm的细沙。沟内每隔约1米砌一个30cm见方的砖垛。砖垛的用途，即可供人检查苹果时立脚用，又能借砖的导热性能，加快底层苹果散热。
沟藏的苹果应适当晚采，一般在寒露后七天采收。此时气温已较低，采下的果实可直接入沟贮藏。9-10月中旬之间采收的果实，采后堆于阴凉干燥处进行预冷。高度不超过30cm。白天盖席遮荫，夜间揭席放露，降低果温。至霜降前后选果入沟。贮藏时，若沟内土壤比较干燥，可先喷洒少量水。果实在沟内的堆积厚度一般为60-80厘米，沟内分段堆放，留有一定空间，或每隔3-5米，竖立草把或秸秆把通风。冬季在果面上覆盖防寒，随气温的下降，逐渐加厚覆盖层，最后可达30里面左右。沟上搭席呈屋脊形，防止雨雪渗入。
沟藏的优点是：不需特殊建筑材料，简单易行，成本低。缺点是受季节影响，贮藏期短，到春季地温回升，果实需要立即出沟，否则很快腐烂变质。
2、通风贮藏库
通风贮藏库是目前商业上贮藏苹果应用最为广泛的一种方式。此库型具有隔热保温条件，利用库内外的温差及昼夜温度的变化，以通风换气的方式，来保持库内比较稳定和适宜的贮藏温度。由于通风贮藏库仍然是依靠自然温度调节库内温度，因此在气温较高或过低的地区和季节，如果不加其它辅助设施，仍然难以维持理想的温度条件。
苹果入库前，库房要清扫，晾晒和密闭消毒。库房的消毒常用硫磺熏蒸，每100立方米库容约用硫磺3公斤。应用的方法是：把硫磺和锯末混合后点燃，使其产生二氧化硫，密闭两天左右，再打开通风。或用福尔马林1份加水40份，配成1%溶液。喷布地面及墙壁，密闭24小时后通风。
苹果在入库前需经预冷，等到库温降至10℃左右时入库。果箱在库内的堆码方式以花垛形式为好，垛下垫砖或枕木，垛与墙壁留有空隙，垛间留通道，以便通风换气。通风贮藏库的管理工作主要是调节库内的温度与湿度。因此必须在库内安装有代表性的部位设置温度计和湿度计，以便根据库内外温湿度的变化，灵活掌握通风换气的时间、次数和通风量。
影响通风速度的主要因素：一是库内外的温差。温差越大，通风越速，所以通风换气应在库内外温差较大时进行。春、秋季要做到“三勤”即：勤关、勤开、勤查，以使库内温度及湿度达到或接近适宜水平。二是风速，风速越大，通风速度越快。因此，在风速小时，为使气温调节速度提高，在不受冻害的条件下，可将全部通风设备打开。三是大气压。库内外气压差越大，气体对流速度越快。冬季以保温为主，只是在大气温度较高时，进行短时间的通风换气。
3、冻藏
在气温比较低的地区，冬季还可以利用自然低温使果实冻结后贮藏。苹果品种不同，耐低温的程度有很大差异。
苹果能否冻坏主要取决于三个因素：品种、冻结时的低温程度和在低温下持续的时间。就目前国内外对苹果冻藏来看，多数苹果品种而言，长期的冻结温度宜在-3℃左右较为适宜。苹果一般在-4℃冻结4个月即不能恢复生机。
在冷藏库冷藏时，库温的降升要保持缓慢而稳定，避免温度骤然升高或降低，库内各部位的温度力求均衡。应特别注意的是解冻必须缓慢进行，否则，果实细胞间的冰晶体融化后不能被原生质吸收，使果实的生理机能遭到破坏。轻则果肉发绵，重则腐烂流汁失去生机。此外，果实一旦冻结后就不能任意版冻结，以免发生机械损伤。还要避免在解冻后重复冻结。